Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CTDSP2O14595 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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