Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EBAG9O00559 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms