Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms