Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H7C1D1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H7C1D1 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H7C1D1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H7C1D1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H7C1D1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H7C1D1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H7C1D1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H7C1D1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H7C1D1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H7C1D1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H7C1D1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
H7C1D1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H7C1D1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H7C1D1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H7C1D1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H7C1D1 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H7C1D1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H7C1D1 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H7C1D1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
H7C1D1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H7C1D1 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H7C1D1 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
H7C1D1 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H7C1D1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H7C1D1 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H7C1D1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
H7C1D1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
H7C1D1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H7C1D1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H7C1D1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H7C1D1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H7C1D1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H7C1D1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H7C1D1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H7C1D1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H7C1D1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H7C1D1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H7C1D1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H7C1D1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H7C1D1 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H7C1D1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H7C1D1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H7C1D1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H7C1D1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
H7C1D1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H7C1D1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H7C1D1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H7C1D1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H7C1D1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H7C1D1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C1D1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C1D1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C1D1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C1D1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C1D1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C1D1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C1D1 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C1D1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C1D1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C1D1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C1D1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C1D1 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C1D1 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C1D1 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C1D1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C1D1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C1D1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C1D1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C1D1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C1D1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C1D1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C1D1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C1D1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C1D1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C1D1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
H7C1D1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H7C1D1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H7C1D1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H7C1D1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H7C1D1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H7C1D1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H7C1D1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H7C1D1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H7C1D1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H7C1D1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H7C1D1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H7C1D1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
H7C1D1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H7C1D1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H7C1D1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H7C1D1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H7C1D1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H7C1D1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H7C1D1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
H7C1D1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H7C1D1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H7C1D1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H7C1D1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H7C1D1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms