Protein–RNA interactions for Protein: A8MUK1

USP17L5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L5A8MUK1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L5A8MUK1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L5A8MUK1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms