Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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