Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC169A6NNP5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC169A6NNP5 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms