Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRCP1A6NGW2 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRCP1A6NGW2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRCP1A6NGW2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRCP1A6NGW2 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRCP1A6NGW2 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRCP1A6NGW2 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRCP1A6NGW2 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRCP1A6NGW2 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRCP1A6NGW2 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRCP1A6NGW2 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRCP1A6NGW2 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
STRCP1A6NGW2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
STRCP1A6NGW2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
STRCP1A6NGW2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
STRCP1A6NGW2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms