Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NCOA3Q9Y6Q9 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NCOA3Q9Y6Q9 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCOA3Q9Y6Q9 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCOA3Q9Y6Q9 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCOA3Q9Y6Q9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCOA3Q9Y6Q9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCOA3Q9Y6Q9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCOA3Q9Y6Q9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCOA3Q9Y6Q9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCOA3Q9Y6Q9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCOA3Q9Y6Q9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCOA3Q9Y6Q9 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCOA3Q9Y6Q9 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCOA3Q9Y6Q9 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCOA3Q9Y6Q9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCOA3Q9Y6Q9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCOA3Q9Y6Q9 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCOA3Q9Y6Q9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCOA3Q9Y6Q9 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCOA3Q9Y6Q9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NCOA3Q9Y6Q9 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCOA3Q9Y6Q9 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCOA3Q9Y6Q9 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCOA3Q9Y6Q9 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCOA3Q9Y6Q9 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCOA3Q9Y6Q9 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCOA3Q9Y6Q9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCOA3Q9Y6Q9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCOA3Q9Y6Q9 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCOA3Q9Y6Q9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCOA3Q9Y6Q9 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCOA3Q9Y6Q9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCOA3Q9Y6Q9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCOA3Q9Y6Q9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCOA3Q9Y6Q9 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCOA3Q9Y6Q9 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCOA3Q9Y6Q9 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCOA3Q9Y6Q9 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCOA3Q9Y6Q9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCOA3Q9Y6Q9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCOA3Q9Y6Q9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NCOA3Q9Y6Q9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCOA3Q9Y6Q9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCOA3Q9Y6Q9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCOA3Q9Y6Q9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms