Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms