Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP16Q9Y5T5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms