Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms