Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms