Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DTX4Q9Y2E6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms