Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX6Q9UNH7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms