Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms