Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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