Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
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