Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PNMA2Q9UL42 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms