Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms