Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms