Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CHIC2Q9UKJ5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHIC2Q9UKJ5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms