Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms