Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms