Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBE1Q9UJT0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms