Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms