Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MLH3Q9UHC1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms