Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms