Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms