Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms