Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
IFT57Q9NWB7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFT57Q9NWB7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFT57Q9NWB7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFT57Q9NWB7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFT57Q9NWB7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFT57Q9NWB7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFT57Q9NWB7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFT57Q9NWB7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFT57Q9NWB7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFT57Q9NWB7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms