Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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TDP1Q9NUW8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDP1Q9NUW8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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