Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms