Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms