Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP62

GCM1, Chorion-specific transcription factor GCMa, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCM1Q9NP62 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCM1Q9NP62 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms