Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPJQ9HC77 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms