Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLSTN2Q9H4D0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CLSTN2Q9H4D0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CLSTN2Q9H4D0 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CLSTN2Q9H4D0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CLSTN2Q9H4D0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms