Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0U4

RAB1B, Ras-related protein Rab-1B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1BQ9H0U4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms