Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms