Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms