Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LNPKQ9C0E8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LNPKQ9C0E8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LNPKQ9C0E8 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LNPKQ9C0E8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LNPKQ9C0E8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LNPKQ9C0E8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LNPKQ9C0E8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LNPKQ9C0E8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms