Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA4CQ9C0C4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms