Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP74Q9C0B2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP74Q9C0B2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP74Q9C0B2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP74Q9C0B2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP74Q9C0B2 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP74Q9C0B2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP74Q9C0B2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP74Q9C0B2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP74Q9C0B2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP74Q9C0B2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP74Q9C0B2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP74Q9C0B2 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP74Q9C0B2 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP74Q9C0B2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP74Q9C0B2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP74Q9C0B2 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP74Q9C0B2 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP74Q9C0B2 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP74Q9C0B2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP74Q9C0B2 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms