Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms