Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms