Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms