Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM55Q9BYV6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms