Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL603841.1-201ENST00000430516 664 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC8.58□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC8.58□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms