Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms