Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 Metazoa_SRP.12-201ENST00000553249 268 ntBASIC16■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms